Церковь Святого Иоанна Крестителя (The church of St John the Baptist) также известна как Университетская церковь, это одна из самых красивых церквей в Европе, стиль церкви можно описать как раннее барокко. Это первая сакральная постройка в стиле барокко в Словакии. В прошлом здание церкви входило в комплекс университетских зданий. Церковь Святого Иоанна Крестителя была построена в промежутке с 1629 по 1637 гг. на месте средневекового доминиканского монастыря и церкви. Церковь строилась по проекту итальянских архитекторов братьев Пьетро и Антонио Спеццо по приказу Николаса Эстерхази.
В интерьере церкви внимание привлекает огромный деревянный алтарь 1640 г., созданный венскими ремесленниками Книллингом и Штадлером, высота алтаря составляет 20.3 метра, а ширина – 14,8 метров. Иконы и фрески церкви принадлежат кисти итальянских художников Россо, Торнини, Конти. Часть потолочной фрески была создана венским художников Груббером. Церковь по-прежнему воплощает в себе функции духовного учреждения, но здесь часто проходят диспуты на теологические темы.
