Музей располагается в здании монастыря, прилегающего к церкви Святого Доминика. На двух этажах музея выставляются археологические находки и этнологические артефакты, имеющие отношение к индейской культуре, а также разнообразные вещи, связанные с колониальным периодом.
Этнологическая экспозиция включает костюмы, маски, украшения, церемониальные предметы и вещи домашнего обихода, принадлежавшие различным индейским племенам этого региона, а также археологические находки с руин сапотеков и миштеков.
Изюминкой экспозиции считается миштекский клад, состоящий из золота, нефрита, бирюзы и других полудрагоценных камней, найденный в 1932 в могильнике на горе Албан. Среди находок были замысловатые браслеты, ожерелья, серьги, нагрудные пластинки, маски и др.
