Южный проход ведет в украшенную звездчатым сводом Капеллу Санто Калис (Capilla del Santo Caliz), первоначально являвшуюся помещением для собраний (1369 г.). Здесь хранится Священная Чаша, украшенная рубинами и жемчугом, которая, согласно преданию, использовалась на Тайной Вечере и даже, как считают некоторые, и была тем самым легендарным Священным Граалем, в который была собрана кровь Христа во время распятия. До XV века чаша хранилась в монастыре Сан Хуан де ла Пенья в Пиренеях.
В музее собора вы увидите картины Зурбарана, Хуана де Хуанеса и других художников венецианской школы.