Швянтойя представляет собой старое рыбацкое поселение, расположенное у истока одноименно реки. Считается, что именно здесь зародился город-курорт
Паланга.
На территории поселка археологи обнаружили древние поселения и предметы домашнего обихода, возраст которых превышает 5 тысяч лет. Порт Швянтойи был известен еще в XIII веке, местный порт пользовался популярностью в особенности в XVI-XVII вв, когда Клайпеда находилась под немецким правлением. Ко времени прихода на территории
Литвы царской России порт уже утратил свою значимость и медленно отмирал. Деревушка была возвращена Литве только в 1921 г, после чего были предприняты многочисленные попытки восстановить порт, но его все больше и больше скрывали пески. В 1973 году Швянтойя была объявлена административным делением Паланги.