Остров стал известен европейцам после того, как был открыт Колумбом в 1494 году и был объявлен испанской территорией.
После победы Соединённых Штатов в Испано-американской войне
Испания была вынуждена отказаться от своих притязаний на
Кубу. В то же время Исла де ла Хувентуд не был упомянут в соглашении, которое определяло границы Кубы, что вызвало споры между получившей независимость Кубой и Соединёнными Штатами о принадлежности острова. В 1907 году Верховный суд
США вынес решение о том, что остров не принадлежит Соединённым Штатам, а в 1925 г. между США и Кубой было подписано окончательное соглашение о его принадлежности.