Это одна из самых старинных церквей Кошице. Францисканская церковь (Franciscan Church) была восстановлена семейством Перени после большого пожара 1333 г. От оригинальной церкви сохранились рельефы над входом, каменные скамьи у алтаря и сам алтарь Святого Николая. После очередного пожара 1556 г. церковь служила военным оружейным складом, а после и епископальным собором во время, когда епископ Эгера жил в Кошице, поскольку Эгер был захвачен турками.
Интерьер церкви выполнен в стиле барокко, здесь можно увидеть статую Святого Карло Борромео, покровителя семинарии.
Под главным алтарем в склепе похоронен Бенедикт Кисди, епископ Эгерский, основатель первого университета в Кошице.