К западу от Кафедрального собора на краю старого еврейского квартала Худерия находится площадь Санто Томе и одноименная церковь. Первоначально церковь являлась мечетью, но в XIV веке граф Оргас перестроил ее под готический стиль, оставив лишь великолепную башню в стиле «мудехар».
Достопримечательность церкви Сан Томе
«Погребение графа Оргаса»
В церковном флигеле представлена одна из лучших работ Эль Греко - картина «Погребение графа Оргаса» (1586 г.). В ней отражена легенда о том, что умершего графа ввели в рай Св. Стефан и Св. Августин.